Du meinst Paninibilder in alten Userordnern? nein, das gilt nicht, nur für den wo die sie einbinden willst. Willst du auch in älteren FM's aktuelle Paninis und hast nicht für alle den selben userordner kannst/musst/solltest du die auch da ersetzen.
Edit: Das Megapack ist die Grundversorgung. Da solltest du die alten löschen, alles andere sind nur updates, da dann eben in den bestehenden rdner kopieren und ggf. Dateien überschreiben. Das funktioniert zwar prinzipiell auch mit dem Megapack so, allerdings ist das aufgrund der Masse an Dateien doch ein gewisser Aufwand für deinen Rechner.
Es wird übrigens, vermutlich bis morgen Abend, neue Links für die Paninis geben weil die alten respektive aktuellen ja doch arg rumzicken. Wenn also der Download spinnt, ab morgen dürfte es besser werden.